不少人质疑朱元璋或者他儿子朱棣的宗教属性，有的人认为他们是色目人，是正宗的回族穆斯林，而不是“汉人”后来改信伊斯兰教。

　　有一个来自台湾的中国穆斯林，他姓张，名字教约瑟夫(Yusuf)。 他认为朱元璋或他儿子朱棣是穆斯林，台湾还有其他学者为此专门写了一本书。张先生说，他的祖先娶了明朝的公主，因此，他也算是朱元璋的后裔，也因此了解明朝皇族信仰穆斯林的秘密。

　　他还提供了令人震惊的证据来支持其观点，这些证据有：

　　1。朱元璋小的时候，他的家人在饥荒中死亡，朱元璋用白布包裹尸体，而用白布包裹尸体正是穆斯林葬礼特征。伊斯兰教规定穆斯林亡者须穿“克凡”(白布殓衣)后土葬。
注：海外著名史学家黎东方博士所着的细说中国历史系列中《细说明朝》记载：“他是贫农家庭的安分守己的子弟，在他十七岁的一年，元顺帝至正四年(1344年)旱灾，蝗虫与瘟疫先后降临到他的家乡，濠州钟离县(安徽凤阳)，父亲朱世珍，母亲陈氏，大哥朱兴隆，在几天内相继去世，家里的现款极少，买不起三口棺材，更买不起坟地，幸亏有邻居刘家心好，准他和二哥朱兴盛把父母和大哥三人的尸首用白布裹起，埋在刘家坟地的一个角落。”
 

　　2。朱元璋最亲近的文臣武将主要是穆斯林组成，因此，明朝是穆斯林开创建立的。

　　注： 安徽地区有大量的色目人，民间有十回保一朱的说法，分指常遇春、胡大海、冯国勇、冯胜、丁德兴、蓝玉、沐英、华云、李文忠等人。被朱棣篡位后枭首的兵部尚书铁铉就是色目人。在民间文学《大明英烈传》中宣扬他们的武功业绩，形容他们为“刚烈之回民”。

　　3。朱元璋宣布禁酒令，一次，朱元璋一个亲信的儿子违反了这个条例而被处死。伊斯兰信仰者是严厉禁酒的。

　　4。朱元璋的皇后是马夫人，她也是穆斯林，她亲自为朱元璋准备所有食物，即使朱元璋成为皇帝后，马皇后依然坚持为朱元璋准备食品。
 

　　5。明朝皇族的颜色是绿色，而绿色正是伊斯兰的象征。